设计 任务书 文档 开题 答辩 说明书 格式 模板 外文 翻译 范文 资料 作品 文献 课程 实习 指导 调研 下载 网络教育 计算机 网站 网页 小程序 商城 购物 订餐 电影 安卓 Android Html Html5 SSM SSH Python 爬虫 大数据 管理系统 图书 校园网 考试 选题 网络安全 推荐系统 机械 模具 夹具 自动化 数控 车床 汽车 故障 诊断 电机 建模 机械手 去壳机 千斤顶 变速器 减速器 图纸 电气 变电站 电子 Stm32 单片机 物联网 监控 密码锁 Plc 组态 控制 智能 Matlab 土木 建筑 结构 框架 教学楼 住宅楼 造价 施工 办公楼 给水 排水 桥梁 刚构桥 水利 重力坝 水库 采矿 环境 化工 固废 工厂 视觉传达 室内设计 产品设计 电子商务 物流 盈利 案例 分析 评估 报告 营销 报销 会计
 首 页 机械毕业设计 电子电气毕业设计 计算机毕业设计 土木工程毕业设计 视觉传达毕业设计 理工论文 文科论文 毕设资料 帮助中心 设计流程 
垫片
您现在所在的位置:首页 >>计算机毕业设计 >> 文章内容
                 
垫片
   我们提供全套毕业设计和毕业论文服务,联系微信号:biyezuopin QQ:2922748026   
MATLAB实现基于神经网络MIV值分析的肿瘤基因信息提取 毕业论文+源码
文章来源:www.biyezuopin.vip   发布者:毕业作品网站  

题 目 基于神经网络MIV 值分析的肿瘤基因信息提取

摘 要:

本文主要运用统计学及数据挖掘相关知识,以结肠癌基因表达图谱为研究对象,综合运用 GB 指数、BP 神经网络、小波变换和贝叶斯等方法对问题给出求解的过程和结果。

问题一采用 GB 综合指数对无关基因进行筛选。首先计算各个基因的Gini 指数和

Bhattacharyya 距离,其次合理定位阈值,分别在Gini 指数排序和 Bhattacharyya 距离排序中选择 300 个优势位置的基因作为备用基因,最后选择这两组备用基因的交集作为信息基因, 共 114 个。从而降低了基因维度。

问题二结合已有文献,本着创新性和有效性的思想进行基因信息提取。

Ø 首先利用基因间的强相关性进行初步冗余基因的剔除,得到了五组特征基因组;利用 BP 神经网络对这五组基因组进行错判数计算,选取错判率最低、基因子集中基因数量最少的基因特征组作为下一步研究基因子集;

Ø 其次利用平均影响值(MIV)方法来进行筛选基因,通过计算一个基因组合中每个基因的 MIV 值,每次剔除MIV 绝对值处于后 10%的基因进行基因子集的确定;

Ø 最后利用 BP 神经网络来进行 22 个基因子集的错判数计算,最终确定含有 12 个基因的子集为最优基因组合(M85079,T62947,R39209,R84411,T54303,M82919,

H43887,X12671,H08393,M26383,R36977,R87126)。

问题三将每组基因表达值看做基因信号,运用小波转换法对基因数据进行去噪,建立去噪模型。运用 MATLAB 小波工具箱对基因表达数据进行去噪处理,并运用去噪后的基因数据重新进行基因的分类、特征基因的提取。通过对比发现,去噪后的数据进行基因分类时能保留 61 个基因,比原始基因数据少 53 个,特征基因提取为 8 个。

问题四针对给定的若干信息基因,利用聚类分析原理和 Bayes 估计,通过模型建立给出探索其它未知信息基因的思想。

关键字:基因表达谱;GB 指数;MIV;BP 神经网络;小波变换;贝叶斯


目 录


1. 问题重述 1

2. 问题分析 1

2.1. 问题一 1

2.2. 问题二 1

2.3. 问题三 2

2.4. 问题四 2

3. 基本假设 2

4. 符号说明 2

5. 模型建立及求解 3

5.1. 问题一:基因筛选 3

5.1.1. 实验数据分析 3

5.1.2. 信息基因的提取 4

(1)计算 Gini 指数 4

(2)计算 Bhattacharyya 距离 6

(3)GB 综合指标选取信息基因 8

5.2. 问题二:分类信息基因确定 9

5.2.1. 解题思路解析 9

5.2.2. 解题方法理论基础 9

5.2.3. 模型建立与求解 10

(1)特征基因的选取 10

(2)强相关性冗余基因的剔除 10

(3)基于 MIV 值的分类特征子集的选取 11

(4)特征基因组合的检验和比较 13

5.3. 问题三:基因信息去噪 15

5.3.1. 解题方法及思路分析 15

5.3.2. 基因信号去噪 16

(1)信号分解 17

(2)给小波细节系数加阈值 18

(3)信号重建 19

5.3.3. 过滤后基因信号进行分类 21

(1) Gini 指标数据对比 21

(2) Bhattacharyya 距离对比 21

(3)基因提取 22

5.4. 问题四:信息基因求解的数学模型 23

5.4.1. 解题方法及假设 23

5.4.2. 贝叶斯分析 23

(1)Bayes 公式 23

(2)基于 Bayes 方法的聚类算法 24

5.4.3. 调用聚类算法 25

(1)确定初始聚类中心 25

(2)确定初始聚类种子及聚类中心点 25

(3)分类 25

(4)结果分析 25

6. 模型的评价与改进 26

6.1. 模型优点 26

6.2. 模型缺点 26

6.3. 模型的改进 27

参考文献 27



























  全套毕业设计论文现成成品资料请咨询微信号:biyezuopin QQ:2922748026     返回首页 如转载请注明来源于www.biyezuopin.vip  

                 

打印本页 | 关闭窗口
本类最新文章
基于前馈控制的动态电压恢复器(D 光纤的色散补偿方式及应用分析 毕 基于10kV配电网线损的仿真计算
华兴科技公司网络规划与设计 毕业 宠物之家寄养系统的设计与实现 毕 SSM的毕业生去向登记分析管理系
| 关于我们 | 友情链接 | 毕业设计招聘 |

Email:biyeshejiba@163.com 微信号:biyezuopin QQ:2922748026  
本站毕业设计毕业论文资料均属原创者所有,仅供学习交流之用,请勿转载并做其他非法用途.如有侵犯您的版权有损您的利益,请联系我们会立即改正或删除有关内容!