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MATLAB实现基因表达谱的复杂网络研究 毕业论文+源码
文章来源:www.biyezuopin.vip   发布者:毕业作品网站  

题 目 基因表达谱的复杂网络研究

摘 要:

本文采用复杂网络理论,整合基因关联信息和文献中的结果,得到一些关于结肠癌标志基因的可能的结果。首先利用分类信息指数对数据进行初步筛选,选出了 314 个基因。对选出的基因分别做肿瘤样本和正常样本的相关系数矩阵,利用 Kruskal 算法分别对两个相关系数矩阵做最小生成树,然后通过两种方法比较选出阈值,建立起节点间的连边关系,得到致病前后的两个网络。根据复杂网络中的相关理论,分别对肿瘤样本和正常样本进行社区划分,最后通过观察两个样本的网络系统,分析致病前后基因的变化情况,建议了结肠癌的特征基因。

关键字:相关系数矩阵 最小生成树 复杂网络 社区结构


目录

— 问题的重述

二 问题分析

3.1 基因表达谱

三 数据

3.2 文献中发现的结肠癌相关基因

四 方法

4.1 距离矩阵

= 1 -

4.3 基因关系网络

4.3.1 阈值的选取

4.3.2 网络的生成

4.4 社区的划分

5.1 度序列变化

5.2 网络比较

5.3 网络中的几个特殊节点

六 结论














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