编号:170088086601
本科毕业论文(设计)
题 目:
学 院:计算机科学与技术学院
专 业:
年 级:20**级(计软汉1班)
姓 名:
指导教师:*** 教授
完成日期:20**年 ** 月** 日
中文题目
摘 要
内蒙古白绒山羊是一种优良家畜品种,通过EST(表达序列标签)测序在分子水平上获得大量数据,这些数据提供了内蒙古白绒山羊的部分基因信息,为进一步研究与山羊绒生长相关基因奠定基础.
本实验选择内蒙古白绒山羊毛囊兴盛期cDNA文库为研究材料,其中15条HGT (高甘氨酸/酪氨酸角蛋白关联蛋白)的cDNA序列已被国际公共数据库—GenBank数据库接受,其中KRTAP6(角蛋白关联蛋白家族6)家族成员6个,KRTAP7家族成员1个,KRTAP8家族成员2个,KRTAP16成员6个.
通过对不同物种HGT氨基酸序列的比较分析,发现山羊HGT的氨基酸序列与其它哺乳动物如人、小鼠和绵羊的HGT氨基酸序列有很多一致或保守的区域.分析其蛋白功能位点,发现在山羊的HGT中有许多豆蔻酰化位点.
通过对白绒山羊HGT蛋白的二级结构预测,发现绒山羊HGT和其它物种HGT的二级结构中无规则线性长链结构所占比例最多,β-伸展结构占到了较少的部分,几乎没有发现α-螺旋的存在.
关键词:绒山羊;生物信息学;表达序列标签;高甘氨酸/酪氨酸角蛋白关联蛋白(HGT)
English Title
ABSTRACT
In this study,15 HGT cDNA sequences were submitted to the international public database (GenBank) which were chosen from the cDNA library of the Inner Mongolia white cashmere goat during anagen with skin as study material. Among them we find 6 members in KRTAP 6, 1 members in KRTAP7, 2 members in KRTAP8 and 6 members of KRTAP16.
Compared the amino acids sequence of HGT of different species, the results showed that the HGT amino acids sequence of goat had many conservative or identical domain with Human, Mouse and Sheep. Analyzing its Motif discovers that goat HGT have many N-myristoylation site.
The secondary structure of HGT was predicted, the result indicated irregular long chain had a large proportion in the HGT secondary structure of goat and other species, there were a small quantity of β- extended structures and α- helix were almost not found.
Key Words:Cashmere Goat;Bioinformatics;EST(Express Sequence Tags);HGT(high glycine/ tyrosine Keratin Associate Protein KRTAP)
引 言
我国绒山羊资源丰富,所产羊绒以其纤维细软、保暖、洁白等特点,素有“软黄金”之称。在国际市场上享有盛誉。内蒙古白绒山羊是一种对恶劣环境适应性极强而又能为人们提供优质纺织纤维的优良家畜品种,无论从基础理论还是应用前景,绒山羊都是极具研究价值的重要家畜。根据美英等西方发达国家政府和世界粮农组织(FAO)的预测,2l世纪全球动物农业90%的品种都将通过分子育种提供,因此,建立内蒙古白绒山羊种质资源库,开展绒山羊产绒量和绒毛品质等相关的功能基因的研究对绒山羊的选育有重要的理论和实际意义.随着人类基因组计划、模式动物基因组计划和家养动物基因组计划研究的深入,已获得了大量基因组水平的数据。这些工作为绒山羊功能基因组研究的开展打下了基础。利用EST(表达序列标签)的分析并获得全长的cDNA序列,从而得到此基因转录的蛋白,对蛋白特征、结构的分析将对阐述山羊毛或绒的特性及表达有着重要的意义。
1生物信息学研究进展
1.1 生物信息学的产生
20世纪中叶以来,随着DNA双螺旋结构的提出和蛋白质空间结构的解析,开始了分子生物学时代。对遗传信息载体构成和生命功能的体现者蛋白质的研究,成为生命科学研究的主要内容。九十年代初随着人类基因组计划在世界范围内的开展,破解人类及多种模式生物的遗传密码已成为生物学领域的重要课题,同时产生了巨量的基因组信息。面对如此巨大且具有高度复杂性的生物数据,如何有效地进行管理和分析这些信息是人类基因组研究必不可少的重要内容,从而也促进了生物信息学(Bioinformatics)这门生物学和信息科学融合的新学科产生和发展[10]。
1.2 生物信息学的发展
1.2.1 生物信息学国内发展现状
1.2.2生物信息学国外发展现状
生物信息学是内涵非常丰富的学科,其核心是基因组信息学,包括基因组信息的获取、处理、存储、分配和解释。基因组信息学的关键是“读懂”基因组的核苷酸顺序,即全部基因在染色体上的确切位置以及各DNA片段的功能;同时在发现了新基因信息之后进行蛋白质特征的分析及空间结构的预测[5、6]。
2 生物DNA信息研究
生物信息学是内涵非常丰富的学科,其核心是基因组信息学,包括基因组信息的获取、处理、存储、分配和解释。
2.1 基因信息学的产生
基因组信息学的关键是“读懂”基因组的核苷酸顺序,即全部基因在染色体上的确切位置以及各DNA片段的功能;同时在发现了新基因信息之后进行蛋白质特征的分析及空间结构的预测。
2.2 基因信息学的发展
结 束 语
本文主要研究了(归纳总结了)...;还有××××问题尚需在今后的学习和工作中进一步解决。
参考文献
[1] 荣国斌编著.高等有机化学(修订本)[M].上海:华东理工大学出版社,2001,15-140.
[2] 梁保安,付华锋.原子吸收光谱法测定花粉中的微量元素[J].光谱学与光谱分析,2007,27(8):1640-1643.
[3] 谢岱.银杏叶微量元素分析[ J].微量元素与健康研究,1999,16(4):75-76.
[4] 罗辉,张建和,揭新明,等.高良姜不同部位无机元素含量及溶出率的研究[J].微量元素与健康研究,1999,16(3):31-32.
[5] Garg A,Garg S,Zaneveld L J,etal. Chemistry and pharmacology of the Citrus bioflavonoid hesperidin[J].PhytotherRes,2001,15(8):655~69.
致 谢
经过几个月的忙碌和学习,本次毕业论文设计已经接近尾声。作为一个本科生的毕业设计,由于经验的匮乏,难免有许多考虑不周全的地方,如果没有指导教师的的督促指导,想要完成这个设计是难以想象的。
我发现,自身的成长离不开大家的支持和帮助,我很庆幸自己生活在这样的空间。我要向那些帮助过我、鼓励过我的人们致以我最诚挚的谢意。
感谢***老师,这次毕业设计中,作为我的指导老师,虽然平日里工作繁多,但在我做毕业设计的每个阶段都给予了我悉心的指导。他严谨的工作作风,渊博的知识,还有平易近人的人格魅力将会对我影响深远。除此之外还让我明白了许多做人的道理。
编写毕业论文是一个学习的过程,论文的完成,奠定了我的能力,它会帮助我在今后的工作与学习当中更加有自信。
最后向各位老师和同学们致以真挚的谢意,谢谢你们的大力支持和帮助。
关于毕业论文(设计)格式的补充说明
1.图的格式要求如下:
(1)按“图 章编号.顺序号+图标题”的形式进行,如:图1.1 环境变量路径、图1.2环境变量配置界面 等等;
(2)图的标题在图的下面,居中,五号、宋体(英文、数字等为Times New Roman),1.5倍行距。
例如:
图1.1 环境变量路径
图1.2 环境变量配置界面
2.表的格式要求如下:
(1)按“表 章编号.顺序号+表标题”的形式进行,如:表3.1 department(院系信息)表、表3.2 infringe(违章信息)表 等等。
(2)表标题在表的上方,居中,五号、宋体(英文、数字等为Times New Roman),1.5倍行距。
(3)表中的内容:五号、宋体(英文、数字等为Times New Roman)。
(4)表的大小尽量以一页的页面为限,一旦超限要加续表及标题。
例如:
表3.1 department(院系信息)表
中文名称
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英语名称
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字段名
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数据类型
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描述
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院系编号
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departmentid
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departmentid
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int
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主键,自动增加,不可空
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院系名称
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departmentname
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departmentname
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varchar
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表3.2 infringe(违章信息)表
中文名称
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英语名称
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字段名
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数据类型
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描述
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车辆编号
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vehicleid
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vehicleid
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int
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学生编号
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studentid
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studentid
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int
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违章次数
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amount
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amount
|
int
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3. 代码、表格除极特殊情况不允许截图。
4. 正文中不能出现“1、2、…”等与一级标题混淆的编号。
5.中文题目及摘要、英文题目及摘要、结束语、参考文献、致谢分别单独占一页。
6.模板中的说明性和补充性说明文字在提交毕业论文(设计)时请删掉。